De Lage Dwarsvaart is een kanaal tussen de Lage Vaart en het Markermeer in de Nederlandse provincie Flevoland. Hij begint als een zijtak van de Lage Vaart bij de A6 en de Hollandse Hout net ten zuiden van Lelystad en gaat onder enkele verkeersbruggen.
Vervolgens komt het kanaal bij het industrieterrein Noordersluis, waar een zijtak, het Havendiep, door Noordersluis gaat naar de wijk Tjalk.